该剧根据知名动画片《青蛙王子之蛙蛙魔法学校》改编，讲述了鲨鱼大钢牙被青蛙王子和他的伙伴们打败后并未死心，又回到魔法学校，抢走青蛙王子的魔法宝盒。青蛙王子和他的伙伴们为了夺回魔法宝盒，一起到海底寻找魔法深渊，与大钢牙斗智斗勇。这一路上他们经历了许多曲折离奇的事情，最终通过大家的团结一致找回了宝盒。

《蛙蛙魔法学校之深渊大作战》坚持为小朋友们打造一个充满想象力的世界。这个世界里面有对事物的好奇，敢于冒险、勇于承担责任，乐于创造、团结一致等等美好的品格。在表现手法上，为配合剧情，该舞台剧采用人、偶同台的演绎方式